中科大停止知网查重的原因主要是因为知网系统的不稳定性和数据准确性受到质疑。知网作为一家第三方查重平台，其算法和数据来源一直备受争议，中科大停止使用知网查重也是为了提高查重的准确性和公正性。此举也引起了广泛关注，许多高校开始重新审视查重系统的选择。

此外，中科大停止使用知网查重还有可能是为了推动自主研发查重系统的发展。随着科技的不断进步，越来越多的高校开始注重自主研发查重系统，以确保查重结果的准确性和可靠性。中科大停止知网查重的举措也将对其他高校的查重系统选择产生一定影响，推动行业的进步和发展。